Survey Insect Population

Procedimiento

Paso 1: Diseñar el Muestreo

Definir qué se quiere aprender, dónde se muestreará y cuánto esfuerzo se invertirá. El diseño del muestreo determina el poder estadístico y la validez ecológica de todo lo que sigue.

Survey Design Framework:
+--------------------+------------------------------------------+
| Component          | Define Before Fieldwork                  |
+--------------------+------------------------------------------+
| Objectives         | What ecological question does this       |
|                    | survey answer? Examples:                 |
|                    | - "What is the species richness of       |
|                    |   ground beetles at Site A?"             |
|                    | - "How does pollinator diversity differ   |
|                    |   between restored and unrestored        |
|                    |   meadows?"                              |
|                    | - "Has moth diversity changed since the   |
|                    |   2020 baseline survey?"                 |
+--------------------+------------------------------------------+
| Target taxa        | All insects? A specific order (e.g.,     |
|                    | Coleoptera)? A functional group (e.g.,   |
|                    | pollinators)? Narrower focus = more      |
|                    | reliable identification and analysis.    |
+--------------------+------------------------------------------+
| Study site(s)      | Geographic boundaries of the survey      |
|                    | area. Map the site. Identify distinct    |
|                    | habitat types within the site.           |
+--------------------+------------------------------------------+
| Sampling design    | Random, stratified random, or systematic |
|                    | placement of sampling points/transects.  |
|                    | Stratify by habitat type if the site     |
|                    | is heterogeneous.                        |
+--------------------+------------------------------------------+
| Replication        | Minimum 3 replicates per habitat type    |
|                    | or treatment. More replicates increase   |
|                    | statistical power but require more       |
|                    | effort. For species accumulation curves  |
|                    | to stabilize, 5-10 replicates per       |
|                    | habitat are often needed.                |
+--------------------+------------------------------------------+
| Temporal scope     | Single survey (snapshot) or repeated     |
|                    | surveys (monitoring)? If monitoring,     |
|                    | define frequency (monthly, seasonal,     |
|                    | annual). Match frequency to the          |
|                    | phenology of target taxa.                |
+--------------------+------------------------------------------+
| Effort             | Define standardized effort per sample:   |
|                    | "20 sweep net sweeps per transect" or    |
|                    | "pitfall traps open for 72 hours" or     |
|                    | "light trap operated 20:00-02:00."       |
|                    | Consistent effort across samples is      |
|                    | essential for comparison.                |
+--------------------+------------------------------------------+

Esperado: Un protocolo de muestreo escrito especificando objetivos, taxones objetivo, descripción del sitio, diseño de muestreo (aleatorio/estratificado/sistemático), número de réplicas, alcance temporal y esfuerzo estandarizado por muestra.

En caso de fallo: Si los objetivos del muestreo son vagos ("ver qué insectos hay aquí"), refinarlos en una pregunta comprobable antes de proceder. Un muestreo sin objetivos claros no puede diseñarse correctamente, y los datos resultantes pueden no responder bien ninguna pregunta. Si el acceso al sitio está restringido, modificar el diseño para funcionar dentro de las restricciones en lugar de reducir la replicación por debajo de 3 por grupo de comparación.

Paso 2: Elegir Métodos de Muestreo

Seleccionar métodos apropiados para los taxones objetivo, el hábitat y los objetivos del muestreo. Diferentes métodos tienen diferentes sesgos de captura.

Method Selection by Target Taxa:
+--------------------+------------------------------------------+
| Target             | Recommended Methods                      |
+--------------------+------------------------------------------+
| Ground-dwelling    | Pitfall traps (primary), hand collection |
| insects (Carabidae,| under rocks/logs, bark traps, Berlese    |
| Staphylinidae,     | funnels for soil fauna                   |
| ants, crickets)    |                                          |
+--------------------+------------------------------------------+
| Vegetation-        | Sweep netting (primary), beating trays,  |
| dwelling insects   | vacuum sampling (D-vac or G-vac),        |
| (Hemiptera,        | branch clipping for canopy               |
| Chrysomelidae,     |                                          |
| Orthoptera)        |                                          |
+--------------------+------------------------------------------+
| Flying insects     | Malaise traps (Diptera, Hymenoptera),    |
| (general)          | flight intercept traps, window traps     |
+--------------------+------------------------------------------+
| Pollinators        | Pan traps (yellow, white, blue bowls),   |
| (bees, hoverflies) | transect counts (visual observation),    |
|                    | sweep netting on floral resources        |
+--------------------+------------------------------------------+
| Nocturnal flying   | Light traps (mercury vapor or UV),       |
| insects (moths,    | sugar baiting (for moths), light sheets  |
| many beetles)      |                                          |
+--------------------+------------------------------------------+
| Aquatic insects    | Kick-net sampling (streams), D-frame     |
| (Ephemeroptera,    | net sampling, Surber sampler             |
| Plecoptera,        | (quantitative), artificial substrates    |
| Trichoptera)       |                                          |
+--------------------+------------------------------------------+
| Butterflies        | Pollard walk transect counts (standard   |
|                    | visual survey method for butterflies),   |
|                    | timed counts per habitat patch           |
+--------------------+------------------------------------------+

Standardization Rules:
- Use the same method, equipment, and effort at every sample point
- Record start and end times for every sampling event
- If using traps, record deployment and retrieval times exactly
- Weather-dependent methods (sweep netting, transect walks) should
  only run under acceptable conditions (no heavy rain, temperature
  above activity threshold for target taxa)

Esperado: Uno o más métodos de muestreo seleccionados y justificados para los taxones objetivo, con esfuerzo estandarizado en todas las réplicas y puntos de muestreo.

En caso de fallo: Si un solo método produce muy pocos especímenes para un análisis significativo, considerar agregar un método complementario. Sin embargo, los datos de diferentes métodos deben analizarse por separado — no mezclar datos de trampas de caída con datos de red de barrido en el mismo análisis de diversidad, ya que muestrean diferentes porciones de la comunidad con diferentes probabilidades de captura.

Paso 3: Ejecutar el Trabajo de Campo

Desplegar equipo de muestreo, realizar recolecciones y registrar todos los metadatos necesarios para el análisis.

Field Execution Checklist:

Before each sampling event:
- [ ] Record date, time, GPS coordinates of sample point
- [ ] Record environmental covariates (temperature, humidity, wind,
      cloud cover) — see observe-insect-behavior for details
- [ ] Verify equipment is clean and functional
- [ ] Label collection containers with site, date, replicate number

During sampling:
- [ ] Follow the standardized effort exactly (same number of sweeps,
      same trap duration, same transect length)
- [ ] Keep specimens from each sample point in separate, labeled
      containers — never mix samples
- [ ] Record any deviations from protocol (e.g., "trap knocked over
      by animal, collected after 48h instead of 72h")
- [ ] Note any unusual observations (mass emergence, swarming events,
      absence of expected taxa)

After each sampling event:
- [ ] Verify all containers are labeled
- [ ] Record end time and any changes in weather during sampling
- [ ] Preserve specimens promptly (kill jar or ethanol) — do not leave
      live specimens in collection bags for extended periods
- [ ] Store preserved specimens in a cool location until processing

Esperado: Todas las muestras planificadas recolectadas con esfuerzo estandarizado, cada muestra en un contenedor etiquetado por separado, con metadatos completos registrados para cada evento de muestreo.

En caso de fallo: Si una muestra está comprometida (trampa perturbada, lluvia fuerte durante el barrido con red), registrar el problema y descartar la muestra o anotarla como posible valor atípico. Es mejor tener una réplica menos que incluir datos comprometidos. Si el clima impide el muestreo en una fecha planificada, reprogramar al día adecuado más cercano — no intentar muestrear bajo condiciones inapropiadas.

Paso 4: Identificar Especímenes

Clasificar e identificar todos los especímenes recolectados al nivel taxonómico práctico más bajo. Este es típicamente el paso que más tiempo consume.

Identification Workflow:

1. SORT to order — separate beetles from flies from wasps etc.
   Use the dichotomous key in the identify-insect skill.

2. SORT to morphospecies within each order — group visually
   identical specimens together. Assign a temporary code
   (e.g., "Coleoptera sp. 01", "Diptera sp. 14").

3. IDENTIFY morphospecies to the lowest level achievable:
   - Family (achievable for most insects with general keys)
   - Genus (achievable for well-studied groups with regional keys)
   - Species (achievable for well-known groups; may require
     specialist confirmation for others)

4. VERIFY identifications by:
   - Cross-checking multiple specimens of each morphospecies
   - Comparing against reference collections
   - Sending representative specimens to taxonomic specialists
     for difficult groups

5. RECORD in a species-by-sample matrix:
   Rows = species (or morphospecies)
   Columns = sample points
   Cells = abundance (count of individuals)

   Example:
                   Site A    Site A    Site B    Site B
                   Rep 1     Rep 2     Rep 1     Rep 2
   Carabidae sp.01    12        8        3         5
   Carabidae sp.02     0        1        7         9
   Staphyl. sp.01      3        4        2         1
   ...

Taxonomic Resolution:
- For diversity comparisons, all specimens must be identified to
  the SAME taxonomic level. Do not mix species-level IDs with
  order-level IDs in the same analysis.
- Morphospecies sorting is acceptable and widely used in ecological
  surveys, especially in tropical regions or poorly known taxa.
- Keep voucher specimens for every morphospecies (see
  collect-preserve-specimens) so identifications can be verified later.

Esperado: Todos los especímenes clasificados e identificados al menos a nivel de morfoespecie, registrados en una matriz de abundancia especies-por-muestra, con especímenes de referencia preservados para cada morfoespecie.

En caso de fallo: Si ciertos grupos no pueden identificarse ni siquiera a morfoespecie (ej., Diptera muy pequeños que todos se ven iguales), registrarlos como un taxón agregado (ej., "Diptera spp. sin clasificar") y anotar la limitación. Excluir grupos pobremente resueltos de los análisis de diversidad en lugar de introducir identificaciones inciertas. Si la identificación se estanca, enviar especímenes a especialistas — esto es normal y esperado en muestreos profesionales.

Paso 5: Calcular Índices de Diversidad

Convertir la matriz de abundancia especies-por-muestra en medidas cuantitativas de diversidad.

Diversity Metrics:

1. SPECIES RICHNESS (S)
   The simplest measure: count of distinct species (or morphospecies)
   in a sample.
   Example: 23 morphospecies in Site A pitfall traps.

2. SHANNON-WIENER DIVERSITY INDEX (H')
   Accounts for both richness and evenness.

   H' = - SUM( pi * ln(pi) )

   where pi = proportion of total individuals belonging to species i
   (pi = ni / N, where ni = count of species i, N = total individuals)

   Interpretation:
   - Typical range: 1.5 to 3.5 for most ecological communities
   - Higher values = more diverse (more species, more evenly distributed)
   - H' = 0 when only one species is present
   - Maximum H' = ln(S) when all species are equally abundant

3. SIMPSON DIVERSITY INDEX (1 - D)
   Probability that two randomly chosen individuals belong to different
   species.

   D = SUM( pi^2 )
   Simpson diversity = 1 - D

   Interpretation:
   - Range: 0 to 1
   - Higher values = more diverse
   - Less sensitive to rare species than Shannon; dominated by
     common species
   - 1 - D = 0.9 means a 90% chance two random individuals are
     different species

4. EVENNESS (J')
   How equally individuals are distributed among species.

   J' = H' / ln(S)

   Interpretation:
   - Range: 0 to 1
   - J' = 1 means all species equally abundant
   - J' close to 0 means one or few species dominate

5. RAREFACTION
   Compares richness between samples with different total abundances
   by estimating how many species would be found if all samples had
   the same number of individuals.
   - Essential when sample sizes differ (they almost always do)
   - Plot rarefaction curves: species vs. individuals sampled
   - If the curve plateaus, sampling has captured most species
   - If the curve is still rising steeply, more sampling is needed

Esperado: Riqueza de especies, índice Shannon-Wiener, índice Simpson y equitatividad calculados para cada muestra y cada sitio/tratamiento. Curvas de rarefacción graficadas para evaluar la completitud del muestreo.

En caso de fallo: Si los tamaños de muestra son demasiado pequeños para un cálculo confiable de diversidad (menos de 30 individuos por muestra), reportar conteos y abundancias crudas de especies en lugar de índices calculados. Las muestras pequeñas producen valores de índice poco confiables con intervalos de confianza amplios. Anotar el pequeño tamaño de muestra como limitación y recomendar mayor esfuerzo de muestreo para futuros estudios.

Paso 6: Realizar Análisis Estadístico

Comparar la diversidad entre sitios, tratamientos o períodos de tiempo usando métodos estadísticos apropiados.

Analysis Approaches:

1. COMPARING TWO OR MORE SITES/TREATMENTS:
   - Shannon H' values: use Hutcheson's t-test for pairwise comparison
     of Shannon indices, which accounts for differences in sample size
   - Species richness: use rarefied richness for fair comparison
   - Abundance data: use Mann-Whitney U test (2 groups) or
     Kruskal-Wallis test (3+ groups) for non-normal count data

2. MULTIVARIATE COMMUNITY ANALYSIS:
   When comparing entire community composition (not just summary indices):
   - Bray-Curtis dissimilarity matrix: quantifies compositional
     difference between every pair of samples
   - NMDS (Non-metric Multidimensional Scaling): ordination that
     visualizes community similarity in 2D — samples close together
     have similar communities
   - PCoA (Principal Coordinates Analysis): alternative ordination
     based on distance matrices
   - PERMANOVA (permutational ANOVA): tests whether community
     composition differs significantly between groups
   - SIMPER: identifies which species contribute most to differences
     between groups

3. TEMPORAL TRENDS (monitoring data):
   - Plot species richness and diversity indices over time
   - Use linear regression or generalized linear models to test
     for trends
   - Account for seasonal variation by comparing same-season samples
     across years

4. SPECIES ACCUMULATION CURVES:
   - Plot cumulative species against cumulative samples
   - Use Chao1 or Chao2 estimators to predict total species richness
     (including undetected species)
   - If observed richness is far below the Chao estimate, more
     sampling is needed

Minimum Reporting:
- Sample sizes (number of individuals and number of samples)
- Diversity indices with confidence intervals or standard errors
- Statistical test used, test statistic, degrees of freedom, p-value
- Effect sizes where applicable

Esperado: Comparaciones estadísticas completadas con pruebas apropiadas, resultados reportados con estadísticos de prueba y valores p, e interpretación ecológica proporcionada.

En caso de fallo: Si la replicación es insuficiente para pruebas estadísticas formales (menos de 3 réplicas por grupo), reportar estadísticas descriptivas (medias, rangos) y curvas de rarefacción sin pruebas de hipótesis. Reconocer la limitación y recomendar mayor replicación para futuros muestreos. Datos descriptivos de un muestreo bien ejecutado son más valiosos que valores p de un diseño con poder insuficiente.

Paso 7: Reportar Resultados

Compilar el muestreo en un informe estructurado que pueda informar decisiones de manejo, apoyar publicación, o servir como línea base para monitoreo futuro.

Survey Report Structure:

1. SUMMARY
   - Survey objectives
   - Key findings (total species, dominant taxa, notable records)
   - Primary conclusion (1-2 sentences)

2. METHODS
   - Study site description (location, habitat, area, map)
   - Sampling design and methods
   - Sampling effort (number of samples, trap-nights, transect length)
   - Identification methods and taxonomic resolution
   - Statistical methods
   - Survey dates and environmental conditions

3. RESULTS
   - Total specimens collected and identified
   - Species list with abundances per site/treatment
   - Diversity indices table (S, H', 1-D, J' per site/treatment)
   - Rarefaction curves
   - Statistical comparison results
   - Ordination plots (if multivariate analysis performed)
   - Notable records (rare species, new records, invasive species)

4. DISCUSSION
   - How do results compare to previous surveys or nearby sites?
   - What ecological factors explain observed patterns?
   - What are the conservation implications?
   - What are the limitations of this survey?

5. RECOMMENDATIONS
   - Management actions (if applicable)
   - Future monitoring schedule
   - Suggested improvements to survey design

6. APPENDICES
   - Full species list with abundances
   - Raw data (species-by-sample matrix)
   - Environmental covariate data
   - Voucher specimen catalog numbers and repository
   - Photographs of notable specimens or habitats

Data Archiving:
- Deposit raw data in an appropriate repository (Dryad, Zenodo, GBIF)
- Deposit voucher specimens in a recognized museum collection
- Archive the survey report with the managing agency or institution

Esperado: Un informe completo del muestreo con métodos, resultados (incluyendo lista de especies, índices de diversidad, pruebas estadísticas), discusión y recomendaciones. Datos crudos archivados en un repositorio.

En caso de fallo: Si el muestreo está incompleto (ej., no todos los especímenes identificados, réplicas insuficientes para estadísticas), producir un informe preliminar con lo disponible y etiquetarlo claramente como preliminar. Identificar las brechas y el cronograma para completarlas. Un informe preliminar con limitaciones honestas es más útil que ningún informe.

Validación

• Los objetivos del muestreo fueron definidos antes del trabajo de campo
• El diseño de muestreo incluyó replicación (mínimo 3 por grupo de comparación)
• El esfuerzo de muestreo fue estandarizado en todas las muestras
• Cada muestra fue mantenida separada y etiquetada con metadatos completos
• Las covariables ambientales fueron registradas para cada evento de muestreo
• Los especímenes fueron identificados a un nivel taxonómico consistente con ejemplares de referencia preservados
• La matriz de abundancia especies-por-muestra fue construida
• Los índices de diversidad (Shannon, Simpson, riqueza, equitatividad) fueron calculados
• Las curvas de rarefacción fueron graficadas para evaluar la completitud del muestreo
• Las comparaciones estadísticas usaron pruebas apropiadas con estadísticos de prueba reportados
• Los resultados fueron compilados en un informe estructurado con lista de especies y recomendaciones

Errores Comunes

• Sin estandarización del esfuerzo: Comparar una muestra de 10 barridos con una de 50 barridos confunde esfuerzo con diversidad. Cada muestra debe recibir el mismo esfuerzo — mismo número de barridos, misma duración de trampa, misma longitud de transecto
• Mezclar datos de diferentes métodos: Las trampas de caída y las redes de barrido muestrean diferentes comunidades de insectos. Analizar datos mezclados produce un número que no representa con precisión ninguna comunidad. Analizar los datos de cada método por separado
• Muy pocas réplicas: Una sola muestra por sitio no proporciona estimación de la variabilidad intra-sitio ni base para comparación estadística. Mínimo 3 réplicas por grupo de comparación; 5-10 es mejor
• Taxonomía inconsistente: Identificar algunos especímenes a especie y otros a orden en el mismo análisis infla la riqueza aparente en un nivel y la oscurece en otro. Elegir una resolución consistente (ej., todos a familia, o todos a morfoespecie) y aplicarla uniformemente
• Ignorar la estacionalidad: La mayoría de las comunidades de insectos cambian dramáticamente entre estaciones. Comparar un muestreo de primavera con uno de otoño confunde efectos estacionales con cualquier diferencia de tratamiento o sitio. Comparar datos de la misma estación
• Reportar índices de diversidad sin tamaño de muestra: Un Shannon H' de 2.5 con 500 individuos es mucho más confiable que H' de 2.5 con 20 individuos. Siempre reportar tamaños de muestra junto con los índices, y usar rarefacción para comparaciones entre diferentes abundancias

Habilidades Relacionadas

• collect-preserve-specimens — métodos de recolección, preservación y estándares de etiquetado para los especímenes recopilados durante los muestreos
• identify-insect — procedimientos de identificación morfológica para clasificar e identificar especímenes del muestreo
• document-insect-sighting — protocolos de documentación fotográfica que complementan la recolección física
• observe-insect-behavior — métodos de observación conductual para complementar los datos poblacionales con contexto ecológico